本片以一名年輕的葡萄牙耶穌會神父克里斯多夫·費雷拉開始，他目睹了他試圖將天主教信仰帶到日本的皈依者所受的致命酷刑。在日本當局進行酷刑的情況下，神父似乎無能為力地以任何方式幫助他的信徒。